독자적으로 연구하여 정확하게 248종으로 분류하였으며

 

배추흰나비를 16만 마리나 사육하며 개체변이를 연구하기도 했고, 국내 대부분의 나비 이름은 그가 지어주었다. 

그러나 6.25 전쟁이 터지면서 그가 평생을 기울여 채집한 나비 75만 마리로 만들어진 표본들이 불타버리고 말았다.

그 후 서울이 수복되고 국립과학관 재건회의에 가던 중 늦다고 빨리 가다가

대낮에 총 매고 술 먹던 반공청년단원과 부딪혔는데 청년이 술김에 미쳐버렸는지 

 

석주명을 향해 '저기 인민군 장교가 간다'며 붙잡았고

석주명은 '나는 공산군이 아니오. 나는 석주명이라 하는 나비 학자요!' 라고 항변했으나

 

청년은 '나비나 인민군이나 다 같은 버러지다'는 개소리를 하면서 석주명을 살해했고

 

시신을 가마니에 싸서 강물에다 유기했다.

 

 

안타깝게도 석주명을 죽인 청년들의 신원은 현재까지도 오리무중이라고 한다.